Servery s AMD EPYC™ pro výzkum dynamiky mozku

Servery s AMD EPYC™ podporují výzkum dynamiky mozku na Univerzitě Karlově

27. 8. 2024

Výzkumný tým zabývající se výpočetní neurovědou na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy využívá v rámci projektu „Dynamika mozku“ serverové řešení dodané naší společností. Nově nasazené servery s procesory AMD EPYC™ umožňují rozvoj výpočetních modelů mozkové aktivity, které detailně mapují dynamiku mozku.

Rozvoj výpočetních modelů mozkové aktivity

V rámci výzkumných prací vědecké skupiny zabývající se výpočetní neurovědou, vedené Mgr. Jánem Antolíkem, Ph.D., je na Katedře softwaru a výuky informatiky Matematicko-fyzikální fakulty Univerzity Karlovy využíváno serverové řešení, dodané naší společností. Výzkumný projekt „Dynamika mozku“, pro nějž jsou servery konkrétně využívány, je zaměřen na rozvoj výpočetních modelů mozkové aktivity, které zachycují dynamiku mozku v různých časových měřítkách. Několikanásobně navýšená kapacita výpočetního zdroje tak umožní, v rámci konkrétního výzkumného cíle, rozsáhlé biofyzikálně podrobné hodnocení modelu neuronové sítě.

Výzkumný projekt „Dynamika mozku“

Tento projekt je prostřednictvím Operačního programu Jan Amos Komenský spolufinancován Evropským fondem pro regionální rozvoj (EFRR). Má interdisciplinární charakter, kombinující neuropsychologické experimenty, pokročilé neurozobrazovací metody a neinvazivní stimulace s výpočetními modely mozkové dynamiky a strojovým učením. Cíle zahrnují vývoj flexibilních výpočetních modelů pro specifické aplikace, monitorování a predikci mozkových stavů, například u epilepsie, a optimalizaci léčebné stimulace mozku a personalizované farmakoterapie.

Více informací o projektu

Dodané řešení

Týmu odborníků nově pro výpočetní modely pomáhají servery, které disponují procesory AMD EPYC™ 9384X s velkou L3 Cache, využívající technologii AMD 3D V-Cache™. Díky nim celý cluster dosahuje skvělých výkonnostních výsledků – např. dle testu SPEC2017FP rate dosahuje 4 810 bodů. Každý server je sestaven v provedení 1U na značce Asus s kódovým označením RS700A-E12-RS12U a obsahuje dva redundantní napájecí zdroje. Cluster tvoří 5 serverů a maximální spotřeba by se měla pohybovat okolo 5 kW.

Parametr	Cluster
Počet CPU	10 × AMD Epyc™ Genoa-X 9384X
Celková velikost L3 Cache	7 680 MB
Použité CPU	AMD EPYC™ 9384X, 32 jader, základní frekvence 3,1 GHz (boost až 3,9 Ghz), L3 cache 768 MB, TDP 320 W
Celkový výkon	Výkon v pohyblivé řádové čárce dle testu SPEC2017FP rate 4 810 bodů
Celkový počet jader	320
Síťové připojení	Ethernet Dual Port 25GbE
Max. spotřeba	~ 5 kW
Provedení	1U

„Simulace kolegů ze skupiny výpočetních neurověd typicky běží jako nezávislé úlohy na CPU (1 instance-per-socket). Výpočty jsou velmi náročné na propustnost paměti a výrazně je urychluje velká L3 cache. Kvůli podpoře 12 kanálů paměti DDR5 a „3D V-Cache“ s kapacitou 768 MB jsme pořídili 5 strojů s dvojicí 32jádrových AMD EPYC 9384X (24 MB cache na jádro) a 1,5 TB nebo 768 GB RAM (12-channel nebo 6-channel s plánovaným dokoupením zbývajících modulů).“

— Mgr. Martin Mirbauer, Katedra softwaru a výuky informatiky Matematicko-fyzikální fakulty Univerzity Karlovy —

AMD EPYC™ s technologií AMD 3D V-Cache™ („Genoa-X”)

Tyto CPU jsou součástí řady procesorů EPYC™, kterou AMD uvedla na trh pro servery a datová centra. Tento konkrétní model je součástí EPYC™ 9004 série, známé pod kódovým označením „Genoa-X“ a je součástí páté generace serverových procesorů AMD EPYC™, založené na architektuře Zen 4. Klíčovou vlastností procesorů je technologie AMD 3D V-Cache, která podporuje více než 1 GB L3 cache na 96jádrovém CPU. Větší cache umožňuje rychlejší přístup CPU k datům potřebným pro rozsáhlé a náročné výpočetní úlohy.

Více informací o procesorech

Společnost M Computers je Elite partnerem společnosti AMD pro EPYC™ procesory.

AMD Partner

Podívejte se na naše další případové studie, kde byly AMD EPYC™ součástí dodávaného řešení, a na další články věnované těmto procesorům.

Více informací

Testování

Zajímá vás, jak lze procesory AMD EPYC™ využít ve vaší infrastruktuře nebo byste chtěli vyzkoušet výkonnost a vlastnosti těchto procesorů? Vyplňte, prosím, formulář nebo se neváhejte obrátit na Lukáše Vacha.

Lukáš Vach

Intel, AMD servery

M: 731 678 146
lukas.vach@mcomputers.cz